Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl2Q6PA06 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atl2Q6PA06 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms