Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms