Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp12Q6P5B0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp12Q6P5B0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms