Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms