Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mvb12bQ6KAU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mvb12bQ6KAU4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms