Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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