Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms