Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9bQ6EBV9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms