Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fbxo27Q6DIA9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Fbxo27Q6DIA9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fbxo27Q6DIA9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fbxo27Q6DIA9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fbxo27Q6DIA9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fbxo27Q6DIA9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo27Q6DIA9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms