Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms