Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pkp4Q68FH0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp4Q68FH0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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