Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fnip1Q68FD7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fnip1Q68FD7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms