Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms