Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfdp2Q64163 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfdp2Q64163 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms