Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms