Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Polr2kQ63871 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms