Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms