Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn3Q62471 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn3Q62471 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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