Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pabpc2Q62029 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pabpc2Q62029 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pabpc2Q62029 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pabpc2Q62029 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms