Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms