Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rev3lQ61493 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms