Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd2Q61285 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms