Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms