Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms