Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms