Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stxbp3Q60770 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms