Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms