Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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