Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myh1Q5SX40 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myh1Q5SX40 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myh1Q5SX40 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myh1Q5SX40 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myh1Q5SX40 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms