Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms