Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms