Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap44Q5SSM3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms