Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf12Q5SPL2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms