Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms