Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms