Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms