Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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