Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms