Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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