Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms