Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shank3Q4ACU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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