Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5935Q497S0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms