Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms