Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx25Q3ZT31 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Snx25Q3ZT31 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Snx25Q3ZT31 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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