Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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