Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms