Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrfip1Q3UZ39 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrfip1Q3UZ39 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms