Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms