Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms