Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms